Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGGP02679 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGGP02679 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FGGP02679 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGGP02679 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGGP02679 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGGP02679 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGGP02679 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGGP02679 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGGP02679 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGGP02679 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGGP02679 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGGP02679 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGGP02679 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGGP02679 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGGP02679 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGGP02679 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGGP02679 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGGP02679 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGGP02679 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGGP02679 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGGP02679 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGGP02679 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGGP02679 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGGP02679 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGGP02679 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGGP02679 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGGP02679 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGGP02679 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGGP02679 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGGP02679 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGGP02679 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGGP02679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGGP02679 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGGP02679 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGGP02679 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGGP02679 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGGP02679 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGGP02679 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGGP02679 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGGP02679 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGGP02679 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGGP02679 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGGP02679 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGGP02679 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGGP02679 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGGP02679 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGGP02679 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGGP02679 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGGP02679 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGGP02679 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGGP02679 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms