Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGFB1P01137 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1P01137 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms