Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA1P01009 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA1P01009 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERPINA1P01009 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms