Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LDHAP00338 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDHAP00338 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDHAP00338 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LDHAP00338 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDHAP00338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDHAP00338 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LDHAP00338 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDHAP00338 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDHAP00338 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDHAP00338 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDHAP00338 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDHAP00338 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDHAP00338 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDHAP00338 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDHAP00338 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDHAP00338 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDHAP00338 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDHAP00338 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDHAP00338 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDHAP00338 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDHAP00338 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LDHAP00338 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDHAP00338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDHAP00338 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDHAP00338 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDHAP00338 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDHAP00338 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHAP00338 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHAP00338 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHAP00338 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHAP00338 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms