Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIC2O95409 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms