Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC6O95255 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC6O95255 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC6O95255 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC6O95255 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms