Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG2O94898 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms