Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL5O76039 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDKL5O76039 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms