Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD17O75943 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD17O75943 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD17O75943 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD17O75943 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD17O75943 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD17O75943 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAD17O75943 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD17O75943 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD17O75943 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD17O75943 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD17O75943 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD17O75943 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD17O75943 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD17O75943 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD17O75943 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD17O75943 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD17O75943 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD17O75943 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD17O75943 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD17O75943 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD17O75943 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD17O75943 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD17O75943 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD17O75943 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD17O75943 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD17O75943 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD17O75943 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD17O75943 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD17O75943 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD17O75943 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD17O75943 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD17O75943 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD17O75943 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD17O75943 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD17O75943 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD17O75943 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD17O75943 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD17O75943 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms