Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNMDO75829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNMDO75829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNMDO75829 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNMDO75829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNMDO75829 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNMDO75829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNMDO75829 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNMDO75829 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNMDO75829 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNMDO75829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNMDO75829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNMDO75829 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNMDO75829 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNMDO75829 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNMDO75829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CNMDO75829 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNMDO75829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNMDO75829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNMDO75829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNMDO75829 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNMDO75829 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNMDO75829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNMDO75829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNMDO75829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNMDO75829 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNMDO75829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNMDO75829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNMDO75829 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNMDO75829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CNMDO75829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNMDO75829 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNMDO75829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CNMDO75829 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNMDO75829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNMDO75829 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNMDO75829 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNMDO75829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNMDO75829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNMDO75829 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNMDO75829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNMDO75829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNMDO75829 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNMDO75829 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNMDO75829 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNMDO75829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNMDO75829 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNMDO75829 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNMDO75829 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNMDO75829 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNMDO75829 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms