Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EIF3JO75822 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3JO75822 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3JO75822 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms