Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SURF6O75683 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SURF6O75683 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SURF6O75683 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SURF6O75683 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SURF6O75683 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SURF6O75683 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SURF6O75683 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SURF6O75683 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SURF6O75683 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SURF6O75683 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SURF6O75683 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SURF6O75683 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SURF6O75683 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SURF6O75683 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SURF6O75683 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SURF6O75683 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SURF6O75683 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SURF6O75683 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SURF6O75683 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SURF6O75683 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SURF6O75683 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SURF6O75683 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SURF6O75683 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SURF6O75683 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SURF6O75683 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SURF6O75683 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SURF6O75683 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SURF6O75683 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SURF6O75683 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SURF6O75683 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SURF6O75683 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SURF6O75683 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SURF6O75683 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SURF6O75683 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SURF6O75683 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SURF6O75683 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SURF6O75683 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SURF6O75683 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SURF6O75683 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SURF6O75683 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SURF6O75683 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SURF6O75683 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SURF6O75683 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SURF6O75683 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SURF6O75683 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms