Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KATNA1O75449 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KATNA1O75449 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms