Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRP5O75197 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRP5O75197 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRP5O75197 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRP5O75197 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRP5O75197 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRP5O75197 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRP5O75197 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRP5O75197 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRP5O75197 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRP5O75197 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRP5O75197 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRP5O75197 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRP5O75197 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
LRP5O75197 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRP5O75197 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRP5O75197 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRP5O75197 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRP5O75197 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRP5O75197 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRP5O75197 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRP5O75197 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRP5O75197 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRP5O75197 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRP5O75197 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRP5O75197 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRP5O75197 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LRP5O75197 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRP5O75197 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRP5O75197 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRP5O75197 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRP5O75197 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRP5O75197 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRP5O75197 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRP5O75197 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRP5O75197 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRP5O75197 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LRP5O75197 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRP5O75197 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRP5O75197 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRP5O75197 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRP5O75197 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRP5O75197 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LRP5O75197 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LRP5O75197 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LRP5O75197 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LRP5O75197 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRP5O75197 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LRP5O75197 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LRP5O75197 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LRP5O75197 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRP5O75197 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRP5O75197 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRP5O75197 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LRP5O75197 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LRP5O75197 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms