Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPX2O60687 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms