Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REV3LO60673 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REV3LO60673 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REV3LO60673 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REV3LO60673 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REV3LO60673 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REV3LO60673 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REV3LO60673 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REV3LO60673 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
REV3LO60673 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REV3LO60673 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REV3LO60673 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REV3LO60673 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REV3LO60673 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REV3LO60673 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REV3LO60673 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REV3LO60673 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REV3LO60673 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REV3LO60673 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REV3LO60673 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REV3LO60673 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REV3LO60673 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REV3LO60673 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REV3LO60673 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REV3LO60673 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REV3LO60673 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REV3LO60673 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
REV3LO60673 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
REV3LO60673 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REV3LO60673 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REV3LO60673 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
REV3LO60673 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REV3LO60673 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REV3LO60673 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REV3LO60673 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REV3LO60673 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
REV3LO60673 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REV3LO60673 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REV3LO60673 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REV3LO60673 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REV3LO60673 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REV3LO60673 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REV3LO60673 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
REV3LO60673 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REV3LO60673 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
REV3LO60673 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms