Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLIN3O60664 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN3O60664 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms