Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPLO60437 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPLO60437 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PPLO60437 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPLO60437 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPLO60437 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPLO60437 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPLO60437 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPLO60437 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPLO60437 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PPLO60437 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPLO60437 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPLO60437 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPLO60437 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPLO60437 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPLO60437 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPLO60437 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPLO60437 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPLO60437 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPLO60437 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPLO60437 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PPLO60437 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPLO60437 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPLO60437 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PPLO60437 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPLO60437 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPLO60437 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPLO60437 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPLO60437 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPLO60437 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PPLO60437 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPLO60437 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPLO60437 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPLO60437 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPLO60437 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPLO60437 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPLO60437 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPLO60437 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPLO60437 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPLO60437 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPLO60437 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPLO60437 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPLO60437 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPLO60437 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPLO60437 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPLO60437 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPLO60437 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPLO60437 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPLO60437 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPLO60437 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PPLO60437 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPLO60437 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPLO60437 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPLO60437 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPLO60437 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPLO60437 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPLO60437 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPLO60437 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPLO60437 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPLO60437 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPLO60437 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPLO60437 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPLO60437 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPLO60437 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPLO60437 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPLO60437 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPLO60437 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PPLO60437 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PPLO60437 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPLO60437 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPLO60437 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPLO60437 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPLO60437 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPLO60437 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPLO60437 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPLO60437 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPLO60437 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms