Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK2O60296 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK2O60296 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms