Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLIN1O60240 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLIN1O60240 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLIN1O60240 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms