Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1O43719 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1O43719 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms