Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN6O43657 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN6O43657 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN6O43657 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN6O43657 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms