Protein–RNA interactions for Protein: O43653

PSCA, Prostate stem cell antigen, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSCAO43653 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSCAO43653 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSCAO43653 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSCAO43653 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSCAO43653 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSCAO43653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSCAO43653 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSCAO43653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSCAO43653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSCAO43653 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSCAO43653 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSCAO43653 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSCAO43653 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSCAO43653 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSCAO43653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSCAO43653 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms