Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCXO43602 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCXO43602 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCXO43602 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCXO43602 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCXO43602 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCXO43602 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCXO43602 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCXO43602 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCXO43602 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCXO43602 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCXO43602 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCXO43602 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCXO43602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCXO43602 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCXO43602 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCXO43602 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCXO43602 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DCXO43602 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCXO43602 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCXO43602 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCXO43602 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCXO43602 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCXO43602 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCXO43602 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms