Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF749O43361 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF749O43361 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF749O43361 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms