Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAPBPO15533 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAPBPO15533 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms