Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA5O15230 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA5O15230 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms