Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHUKO15111 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHUKO15111 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHUKO15111 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHUKO15111 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHUKO15111 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHUKO15111 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHUKO15111 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHUKO15111 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHUKO15111 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHUKO15111 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHUKO15111 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHUKO15111 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHUKO15111 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHUKO15111 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHUKO15111 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHUKO15111 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHUKO15111 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHUKO15111 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHUKO15111 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHUKO15111 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHUKO15111 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHUKO15111 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHUKO15111 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHUKO15111 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHUKO15111 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHUKO15111 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHUKO15111 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHUKO15111 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHUKO15111 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHUKO15111 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHUKO15111 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHUKO15111 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHUKO15111 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHUKO15111 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHUKO15111 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHUKO15111 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms