Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC80O14777 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC80O14777 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDC80O14777 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDC80O14777 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC80O14777 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC80O14777 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC80O14777 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDC80O14777 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDC80O14777 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDC80O14777 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC80O14777 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC80O14777 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC80O14777 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC80O14777 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC80O14777 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC80O14777 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC80O14777 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC80O14777 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC80O14777 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC80O14777 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC80O14777 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC80O14777 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDC80O14777 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NDC80O14777 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC80O14777 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC80O14777 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC80O14777 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC80O14777 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms