Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 MELTF-203ENST00000439320 629 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 52.3
DDX3XO00571 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 52.3
DDX3XO00571 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.791e-9■■■■■ 52.3
DDX3XO00571 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-31■■■■■ 52.3
DDX3XO00571 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.161e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-214ENST00000483795 1913 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-209ENST00000464228 861 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-208ENST00000463190 570 ntTSL 216.16■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-220ENST00000497031 560 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-217ENST00000490426 1027 ntTSL 215.69■□□□□ 0.11e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-11■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-221ENST00000486766 579 ntTSL 419.98■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-216ENST00000455079 558 ntTSL 418.26■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-209ENST00000431715 581 ntTSL 318.26■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-217ENST00000456708 576 ntTSL 418.26■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-213ENST00000439812 589 ntTSL 518.26■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-218ENST00000457841 699 ntTSL 218.26■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-206ENST00000412355 574 ntTSL 418.19■□□□□ 0.53e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-212ENST00000436856 893 ntTSL 317.58■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-207ENST00000428226 700 ntTSL 515.83■□□□□ 0.123e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 ATG9A-219ENST00000466217 594 ntTSL 213.55□□□□□ -0.243e-10■■■■■ 52.1
DDX3XO00571 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-13■■■■■ 52
DDX3XO00571 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-13■■■■■ 52
DDX3XO00571 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-13■■■■■ 52
DDX3XO00571 IL6R-206ENST00000512471 527 ntTSL 422.99■■□□□ 1.274e-9■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-9■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-9■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.635e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ASS1-205ENST00000422569 807 ntTSL 521.65■■□□□ 1.065e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ASS1-206ENST00000443588 545 ntTSL 511.1□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 51.9
DDX3XO00571 ELP5-213ENST00000574841 510 ntTSL 218.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 ELP5-207ENST00000571146 890 ntTSL 313.68□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 FAAP100-206ENST00000544302 1091 ntTSL 221.55■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 FAAP100-204ENST00000536161 924 ntTSL 317.04■□□□□ 0.325e-9■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.085e-9■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 FAAP100-205ENST00000541246 1101 ntTSL 514.73□□□□□ -0.055e-9■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 FAAP100-203ENST00000443656 3822 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 51.8
DDX3XO00571 WDR61-216ENST00000561347 1131 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.784e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-215ENST00000560946 603 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.344e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-206ENST00000558840 554 ntTSL 414.69□□□□□ -0.063e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-211ENST00000560063 1355 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-212ENST00000560569 1036 ntTSL 512.82□□□□□ -0.363e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 ARNTL2-202ENST00000266503 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.785e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-209ENST00000559848 756 ntTSL 310□□□□□ -0.813e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-208ENST00000559700 948 ntTSL 29.01□□□□□ -0.973e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.015e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.155e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-213ENST00000560610 832 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.473e-15■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-20■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.52□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 410.49□□□□□ -0.732e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 210.2□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 28.72□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.17□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.675e-36■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.995e-36■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-36■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 BCAT1-203ENST00000355164 521 ntTSL 26.28□□□□□ -1.45e-36■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 45.77□□□□□ -1.495e-36■■■■■ 51.7
DDX3XO00571 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-21■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.972e-21■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 C17orf49-206ENST00000549857 2343 ntTSL 219.96■□□□□ 0.792e-21■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.572e-21■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 HBA2-203ENST00000482565 640 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.475e-22■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-22■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 HBA2-204ENST00000484216 403 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.365e-22■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-21■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-22■■■■■ 51.5
DDX3XO00571 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 530.71■■■□□ 2.513e-9■■■■■ 51.4
DDX3XO00571 TNNI3-203ENST00000586446 571 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 ARF4-202ENST00000463880 641 ntTSL 321.59■■□□□ 1.059e-26■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.169e-26■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 ARF4-207ENST00000493378 548 ntTSL 311.27□□□□□ -0.619e-26■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 ARF4-205ENST00000488156 732 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-26■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.665e-11■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.665e-11■■■■■ 51.2
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1776.7 ms