Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFRD1O00458 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFRD1O00458 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms