Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QR89 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QR89 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QR89 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QR89 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QR89 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QR89 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QR89 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QR89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QR89 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms