Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H7C1D1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
H7C1D1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
H7C1D1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
H7C1D1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
H7C1D1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
H7C1D1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H7C1D1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H7C1D1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
H7C1D1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
H7C1D1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
H7C1D1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
H7C1D1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
H7C1D1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
H7C1D1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
H7C1D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
H7C1D1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H7C1D1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H7C1D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H7C1D1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H7C1D1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H7C1D1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H7C1D1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
H7C1D1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
H7C1D1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H7C1D1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
H7C1D1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H7C1D1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H7C1D1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
H7C1D1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
H7C1D1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H7C1D1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H7C1D1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H7C1D1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H7C1D1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
H7C1D1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
H7C1D1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
H7C1D1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
H7C1D1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H7C1D1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H7C1D1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H7C1D1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H7C1D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H7C1D1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H7C1D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H7C1D1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
H7C1D1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
H7C1D1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
H7C1D1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H7C1D1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms