Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 720.7 ms