Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms