Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9IYK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9IYK1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9IYK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9IYK1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9IYK1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9IYK1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9IYK1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9IYK1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C9IYK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9IYK1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9IYK1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9IYK1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9IYK1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9IYK1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9IYK1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9IYK1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9IYK1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9IYK1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9IYK1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9IYK1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9IYK1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9IYK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9IYK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9IYK1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9IYK1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9IYK1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms