Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRDCB7Z8K6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRDCB7Z8K6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms