Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms