Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAC3D1A6NKF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAC3D1A6NKF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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