Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLCD2A6NGC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD2A6NGC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms