Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC162PA2VCL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms