Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIPSLA2A3N6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms