Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVM2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1B0GVM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms