Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
A0A0U1RQJ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms