Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms