Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YYE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YYE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YYE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YYE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms