Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms