Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms