Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms