Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms